Расшифровка генома пациента найденный ген для наследственного неврологического расстройства CMT

Объявление, что они надеются, является новой эрой персонализированной геномной медицины, эксперты в США идентифицировали ген позади пациента, унаследовалневрологическое расстройство, в этом случае форма болезни Charcot-Marie-Tooth, путем упорядочивания его полного генома.Детали поисков издаются онлайн в проблеме 10 марта The New England Journal of Medicine. Среди авторов пациент, ДокторДжеймс Лапский, заместитель председателя молекулярной и человеческой генетики в Медицинском колледже Бэйлора (млрд кубометров) в Хьюстоне, Техас, и доктор Ричард Гиббс, директориз Центра Упорядочивания Генома человека в млрд кубометров, где упорядочивание выполнялось.

Болезнь Charcot-Marie-Tooth (CMT) (который получает ее имя от трех человек, сначала идентифицировавших ее в 1886: Джин-Мартин Шарко и Пьер Марив Париже, Франция, и Говард Генри Тут в Кембридже, Англия), весьма общее наследственное неврологическое расстройство, влияющее на нервы в aконечности человека, руки и ноги (периферические нервы).Согласно Национальному Институту Неврологических расстройств и Инсульта, CMT, который также известен как наследственная моторная и сенсорная невропатия(HMSN) или малоберцовая мышечная атрофия, аффекты приблизительно 1 в 2 500 в США.Лупский сказал прессе, что знал в течение 40 лет, что у него есть «генетически рецессивная болезнь».

Он и его коллеги работали над разыскиванием генетических причин CMT в течение многих десятилетий. В 1991 они издали результаты исследования гдеони идентифицировали первое дублирование на хромосоме, давшей начало CMT. С тех пор 40 других генетических мутаций и изменения были идентифицированыкак приводящий к CMT, но ни один из них не объяснил форму CMT, влияющего на Лупского и некоторые его сибсы.

Поиски закончились ранее в этом году, когда команда в Центре Упорядочивания Генома человека млрд кубометров упорядочила его весь геном и завершилаэто в его случае преступник является геном под названием SH3TC2. Лупский унаследовал две мутантных формы гена, один от каждого родителя.«У меня есть болезнь, и у меня есть два гена мутанта», сказал Лупский.Ни один из родителей Лупского не имел болезнь, но четырех из их детей, унаследованных и копии мутанта гена, и унаследовал болезнь.

Исследователи млрд кубометров взволнованы, потому что это – первый раз, когда они попытались идентифицировать ген болезни путем упорядочивания цельного пациентагеном.«Это демонстрирует, что технология достаточно прочна», сказал Лупский, «Мы можем начать использовать эту технологию, чтобы интерпретировать клиническую информацию вконтекст последовательности – руки карт с Вами имели дело.

Это не цель или мечта о персонализированной геномной медицине?»Исследователи также обнаружили, что человек, несущий только одну из рецессивных мутаций, восприимчив к синдрому канала запястья, болезненномупрогрессивное условие, вызванное сжатием ключевого нерва в запястье и это обычно влияет на людей, выполняющих повторяющиеся движения.Лупский сказал, что это заставляет Вас задаться вопросом, как часто происходит, что перенос только одного гена для рецессивной болезни оставляет человека восприимчивым для комплексачерты.

«Мы будем в состоянии посмотреть на некоторые аллели (генные копии) как это, чтобы видеть то, к чему Вы могли бы быть восприимчивы?»Лупский не является первым геномом, который будет упорядочен, но до сих пор было меньше чем 10 случаев, о которых сообщают, большинство из них интеллектуальные упражнения.

Фактически в2007, Гиббс был одним из ученых, представивших лауреата Нобелевской премии 1953 года Джеймса Уотсона, co-исследователя двойной спирали ДНК и разработчикапроект генома человека, его полный геном на церемонии в млрд кубометров.Лупский сказал, что расшифровка генома не является легкой задачей и «каждый поражен страхом в неспособности интерпретировать многое из того, что мы видим».«В настоящее время мы только знаем функцию 5 процентов к 10 процентам этих приблизительно 25 000 генов в нашем геноме, который это берет, чтобы сделать человекабыть. Я думаю, по крайней мере, что эта бумага говорит нам, то, что данные достаточно прочны, что мы можем начать использовать ее, чтобы интерпретировать клиническую информацию в контекстеиз последовательности генома», добавил он.

Чтобы найти определенную болезнетворную мутацию гена, ученый должен не только понять его последовательность, но также и различные способы, которыми это может измениться(выключатели нуклеотида, удаленный или дублированный генетический материал). И добавил к этому, другой слой сложности: мутации в различных генах могутрезультат при подобных болезнях.

Для исследования Гиббс и коллеги использовали «целый подход» ружья генома, где они взяли геном Лупского, разбил его в маленькие фрагментыназванный «надрезами» (короткий для SNPs, полиморфизмов единственного нуклеотида) и затем клонированный их. Они тогда выделили и упорядочили клонов и использовали aкомпьютерный алгоритм, чтобы повторно собрать геном.

Они идентифицировали все варианты функции в генах, которые, вероятно, будут связаны с CMT.В одной аллели (член генной пары) для SH3TC2, они нашли то, что они назвали мутацией «ерунды», приводящей к преждевременной остановке к строящей белок инструкции. Эта мутация была замечена прежде в пациентах CMT определенных этнических групп.

Они также идентифицировали что они descirbed как a«бессмысленная» мутация в другой аллели, приводящей к производству неправильной аминокислоты (таким образом, примесный белок не может сделать своей работы должным образом внутриклетки).Первая мутация была найдена в одном родителе и двух сибсах, у которых не было CMT, и другой был найден в другом родителе и одном прародителе,у кого также не было болезни.

Только у сибсов, унаследовавших оба гена, была эта определенная форма CMT, включая Лупского.Существуют другие способы упорядочить геномы, которые могут, например, искать определенные изменения, но в этом случае, из-за потенциала различныхвиды изменений в различных генах, некоторые унаследовали recessively, и некоторые доминируя, «целое ружье» подход, как думали, было лучшимвыбор.Авторы написали, что эксперты, изо всех сил пытающиеся понять болезни с подобными генетическими свойствами, должны также рассмотреть попытку этогоподход:«Клинический и эксперты по генетике, борющиеся с плохо понятыми генетическими заболеваниями высокой пенетрантности, должен теперь серьезно рассмотреть этот подход дляосвещение молекулярной этиологии этих случаев, и в конечном счете обеспечение лучшего лечения пациентов для семей, живущих с такими болезнями», онинаписал.

Лупский сказал, что исследование возвещает о начале новой эпохи клинического упорядочивания, посредством чего пациент однажды будет в состоянии проанализировать его или ее геном чтобы копределите лучшее лечение для даже довольно общих нарушений.«Если у Вас есть артериальная гипертензия, мы можем использовать Ваш геном, чтобы выяснить лучшее лечение для Вас? Потребуется много времени. Мы не знаем что 90 процентовиз генов в геноме делают», сказал Лупский, объяснив, что его собственный геном содержит 3,5 миллиона различий к справочному геному, который былупорядоченный в проекте генома человека:«Я ожидаю что сохраняться для других.

Все действительно уникальны», сказал Лупский.Исследование финансировалось Национальным Научно-исследовательским институтом Генома человека и Национальным Институтом Неврологических расстройств и Инсульта.«Упорядочивание целого генома в пациенте с невропатией Charcot-Marie-Tooth».Лупский, Джеймс Р., Рид, Джеффри Г., Gonzaga-Jauregui, Клодия, Рио Deiros, Дэвид, Чен, Дэвид К.И., Назарет, Линн, Бейнбридж, Мэтью, Dinh,

Huyen, Цзин, Chyn, Уилер, Дэвид А., Макгуайр, Эми Л., Чжан, Фэн, Stankiewicz, Павел, Хальперин, Джон Дж., ян, Chengyong, Джехмен, Кертис,Го, Danwei, Irikat, Рола К., Том, Уоррен, Fantin, Ник Дж., Muzny, Донна М., Гиббс, Ричард А.N Engl J Медиана, Изданные онлайновые 10

Март 2010.ДОИ: 10.1056/NEJMoa0908094

Источник: Медицинский колледж Бэйлора, национальный институт неврологических расстройств и инсульта.


12 thoughts on “Расшифровка генома пациента найденный ген для наследственного неврологического расстройства CMT

  1. Він її панічно боїться. І не дарма. По-перше вона чітко повідомила, що, якщо вона прийде до влади, то Янукович сидітиме і все в нього заберуть. Тепер вона точно слова дотримається, а щодо її повернення до влади, то у нас люблять ображених. До того ж Юля персональний партнер Путіна, якого він боїться ще більше. Вона навмисно провокувала Януковича на свій арешт, вірячи, що буде, як у 2001-му – за пару місяців злякаються шуму й випустять. Та не так усе вийшло.

  2. Северный Крым прощается с пресной жизньюКак и предсказывали экологи, запасы пресной воды под землей на севере Крыма иссякают: в водопровод Красноперекопска уже просачивается морская вода с водорослями. Это значит, что в скором времени город может стать непригодным для жизни.

Добавить комментарий