Биологи впервые получили трехмерное изображение оболочки вируса ВИЧ

биолог

Для огромной модели из 64 миллионов атомов потребовался суперкомпьютер Blue Waters с суммарной мощностью в 11,5 петафлопc.Интернациональная несколько биологов впервой опубликовала полную трехмерную модель капсида — защитной оболочки СПИДа, что в возможности разрешит применять информацию об ее устройстве для вакцины от ВИЧ, говорится в статье, размещённой в издании Nature.Шультен и его коллеги взяли первое трехмерное изображение капсида ВИЧ с ядерным разрешением, проанализировав эти "микротомографии" вируса ВИЧ при помощи суперкомпьютера.

Для этого биологи создали особенный компьютерный метод, что неспешно соединял между собой "кусочки" капсида, информация о структуре которых была уже известна."Капсид ВИЧ владеет двумя противоречащими друг другу особенностями. Он обязан защищать генетический материал от повреждений, но наряду с этим он обязан скоро раскрываться в тот момент, в то время, когда он попадает вовнутрь клетки. Скорость раскрытия имеет громадное значение — она должна быть и не через чур стремительной, и не через чур медленной.

Быть может, что нам удастся применять данный факт себе на пользу", — заявил Клаус Шультен (Klaus Schulten) из Иллинойского университета в городе Урбана (США).Для огромной модели из 64 миллионов атомов потребовался суперкомпьютер Blue Waters с суммарной мощностью в 11,5 петафлопc, созданный компанией Cray по заказу университета Иллинойса и Национального центра суперкомпьютерных приложений. По словам биологов, структура капсида была на удивление простой — он является мозаикой из 12 "пятиугольников" и 216 "шестигранников", складывающихся из нескольких молекул одного и того же белка.

Эти элементы способны поменять собственную форму в широких пределах, в зависимости от характера связей с соседними фрагментами "мозаики". Проанализировав их структуру, ученые выделили особенные тройные спирали на границе "швов" на поверхности вируса.

Они утвержают, что эти участки очень важны для стабильности вирусной частицы, что разрешает применять такие спирали в качестве "мишени" для вакцин и будущих лекарств.


Блог Бизнесмена