ДНК, упорядочивающая метод Используя развитые полупроводники – низкая стоимость, портативная и масштабируемая

Ученые из Ion Torrent Systems Inc. создали ДНК, упорядочивающую метод с помощью полупроводников вместо дорогостоящего, и объединяют оптическую технологию. Они говорят, что их устройство имеет намного более низкую цену, это портативно и может быть обновлено (масштабируемое).

Их цель состоит в том, чтобы достигнуть целевой цены 1 000$ для упорядочивания генома.Основатель компании, доктор Йонатан Ротберг, изобретатель машины и команда написали в журнале Nature на этой неделе:«Семенная важность упорядочивания ДНК к наукам о жизни, биотехнологии и медицине стимулировала поиск большего количества масштабируемых и решений меньшей стоимости».Компания утверждает, что их устройство имеет широкий диапазон упорядочивания ДНК от микроорганизмов людям.Устройство, упомянутое компанией как PGM (Личная Машина Генома), использует в широком масштабе параллельное множество датчиков полупроводника, измеряющих водородные ионы, произведенные во время репликации ДНК.

Это сделано в режиме реального времени. Помещенный проще, машина имеет кремниевый чип, имеющий 1,2 миллиона датчиков, состоящих из крошечных скважин – они заполнены бусинками, содержащими нити ДНК, которые будут упорядочены. Хорошо имеет датчики, измеряющие водородные ионы, производящиеся во время репликации ДНК. Упорядочивание ДНК может быть закончено в течение приблизительно двух часов вместо недель.

Вице-президент Систем Потока иона маркетинга и развития бизнеса, джайна Maneesh, сказал, что упорядочивание E. coli в Германии и Китае во время недавних вспышек было идентифицировано в течение первых трех дней с помощью PGMs, а не несколько недель. Это дало бесценное время органов здравоохранения, чтобы делать с этим что-то.

Джайн добавил, что PGM компании используется в лабораториях во всем мире в более чем 40 странах.Доктор Йонатан Ротберг говорит, что их машина использовалась, чтобы расшифровать геном соучредителя Intel, Гордона Мура.

Доктор Ротберг сказал:«Гордон Мур решил все уловки, давшие нам современные полупроводники, таким образом, он должен быть первым человеком, который будет упорядочен на полупроводнике».Устройство кодирования ДНК продает за доллары за 49 000$, значительно меньше что его нынешние конкуренты.

Несколько компаний конкурируют, чтобы достигнуть ценника за 1 000$ для упорядочивания генома человека, ценовые эксперты говорят, мог проложить путь к обычному упорядочиванию в медицинской практике. Системы Потока иона полагают, что они достигнут цели за 1 000$ к 2013.Ученые написали по своей природе что:«(Генетический вариант генома доктора Мура указывает a), 56%-й шанс карих глаз…. типичная сумма веснушки…. умеренно более высокие разногласия пахнущей спаржи в моче».

Авторы добавили, что, удивительно, геном доктора Мура обозначает более высокий риск олигофрении. Очевидно, человек, оказалось, был очень умен, делая одно удивление, насколько полезный эти геномные данные.

Доктор Ротберг подчеркнул, что мы на расстоянии по крайней мере в одно десятилетие от понимания генома человека должным образом; в пути, который мог быть действительно полезным. Однако новое устройство полезно при сосредоточении на выборе генов, как мог бы иметь место при исследовании рака.Последовательность ДНК является точным назначением основ – (аденин), T (тимин), G (гуанин), C (цитозин) – в молекуле ДНК.

Упорядочивание ДНК относится к идентификации точного заказа пар азотистых оснований в сегменте ДНК.«Интегрированное устройство полупроводника, позволяющее неоптическое упорядочивание генома»

Йонатан М. Ротберг, Вольфганг Хинц, Тодд М. Ририк, Джонатан Шульц, Вильям Милеский, Мэл Дэйви, Джон Х. Лимон, Ким Джонсон, Марк Дж. Милгрю, Мэтью Эдвардс, Джереми Хун, Ян Ф. Симонс, Дэвид Маррэн, Джейсон В. Майерс, Джон Ф. Дэвидсон, Annika Branting, Джон Р. Нобайл, Бернард П. Пук, Дэвид Лайт, Трэвис А. Кларк, Мартин Хубер, Джеффри Т. Брэнкифорт, Айзек Б. Стонер, Саймон Э. Коли, Майкл Лайонс и др.Природа 475, 348-352 (21 июля 2011) doi:10.1038/nature10242


6 комментариев к “ДНК, упорядочивающая метод Используя развитые полупроводники – низкая стоимость, портативная и масштабируемая”

Оставьте комментарий