Кодекс генома, резкий для наиболее распространенной формы педиатрического рака мозга

генома

Ученые из Онкологического центра Джонса Хопкинса Киммела расшифровали генетический код для medulloblastoma, наиболее распространенного педиатрического рака мозга и ведущего киллера детей с раком. Генетическая «карта», как полагают, является первой, сообщил педиатрического генома рака и издается онлайн в проблеме 16 декабря Science Express.Особенно, результаты исследования показывают, что дети с medulloblastoma имеют пять – к в десять раз меньшему количеству связанных с раком альтераций их геномов по сравнению с их взрослыми коллегами, говорят ученые.«Эти исследования ясно показывают, что генетические изменения в педиатрических раковых образованиях удивительно отличаются от взрослых опухолей.

С меньшим количеством альтераций надежда состоит в том, что может быть легче использовать информацию, чтобы развить новые методы лечения для них», говорит Виктор Велкулеску, Доктор медицины, доктор философии, адъюнкт-профессор онкологии в Онкологическом центре Джонса Хопкинса Киммела.«Мы теперь знаем, каковы много частей проблемы medulloblastoma», добавляет Берт Воджелштейн, Доктор медицины, профессор Клейтона Онкологии и соруководитель Центра Людвига в Джонсе Хопкинсе. «Теперь, мы должны выяснить, как соединить проблему и ноль в на частях проблемы, чтобы развить новые методы лечения. Это – то, на чем будут сосредоточены ученые в течение следующего десятилетия».Команда Джонса Хопкинса использовала автоматизированные инструменты, чтобы упорядочить сотни миллионов отдельных химикатов, названных нуклеотидами, который пара вместе предопределенным способом построить ДНК и, в свою очередь, геном.

Комбинации этих писем о нуклеотиде формируют гены, предоставляющие инструкциям ту активность клетки гида. Альтерации нуклеотидов, названных мутациями, могут создать ошибки кодирования, преобразовывающие нормальную клетку в злокачественную. Ученые из Джонса Хопкинса ранее картировали последовательности генома для взрослого мозга поджелудочной железы, груди и случаев рака толстой кишки с подобными методами.Для исследования ученые упорядочили почти все кодирующие белок гены в 22 образцах педиатрического medulloblastoma и сравнили эти последовательности с нормальной ДНК от каждого пациента, чтобы идентифицировать определенные для опухоли изменения или мутации.

Каждый образец опухоли имел среднее число 11 мутаций. Было 225 мутаций всего.Затем следователи перерыли второй набор 66 medulloblastomas, включая некоторые образцы от взрослых, чтобы найти, как эти мутации изменили белки, сделанные генами.Команда нашла, что большинство мутаций собирается в пределах нескольких семейств генов или проводящих путей.

Самый распространенный путь заказал пути длинные берега ДНК, составляющие хромосомы, искривленные и сформированные в плотные пакеты, открывающиеся и закрывающиеся в зависимости от того, когда гены должны быть активированы. Такой процесс отрегулирован химикатами, оперирующими за пределами генов, которые называют «эпигенетическими» ученые.В пределах эпигенетического пути два обычно видоизменяемых гена были оба вовлечены в то, как молекулы назвали обертку гистонов вокруг ДНК.

«Эти эпигенетические изменения могут быть более важными, чем мы думали при детском раке», говорит Уилл Парсонс, Доктор медицины, доктор философии, раньше Джонса Хопкинса и теперь доцента в Техасе Детский Онкологический центр и Медицинский колледж Бэйлора.Мутации в MLL2 и MLL3 были идентифицированы в 16 процентах всего набора 88 medulloblastoma образцов. Добавьте к этому три других эпигенетических альтерации, найденные учеными в просмотре генома и общими счетами набора на 20 процентов мутаций во всех образцах рака мозга.Второй к эпигенетическим проводящим путям были генные мутации в проводящих путях, таких как Hedgehog и Wnt, управляющие развитием ткани и органа у людей и другими животными.

Оба проводящих путей были ранее связаны с детством medulloblastoma.Рак является главной причиной смерти из-за болезни в детях в США, и больше детей умирает от опухолей головного мозга, чем какой-либо другой тип рака.

Medulloblastoma является наиболее распространенной злокачественной опухолью головного мозга в детях, происходящих приблизительно в 400 детях в год в США.«Это – определенная проблема лечить детей с раком мозга», говорит Парсонс, «потому что наши наиболее эффективные лечения, хирургия и радиационная терапия, могут вызвать значительные побочные эффекты, включая познавательные ограниченные возможности и гормональные патологии.

Для наших самых молодых пациентов эффекты могут быть потенциально разрушительными».Все же, Пасторы поощряется результатами исследования исследования. «Как онкологи, мы работаем, чтобы понять, как определенные генетические изменения, найденные при раковых образованиях пациентов, должны вести свое лечение.

Любая информация, позволяющая нам понимать прогноз пациента или дающая представления о методах лечения, которые могли бы работать лучше всего в пациенте, является критической и поможет нам оказать лучшую помощь».Исследование финансировалось прежде всего через Инициативу характеристики генома рака (CGCI) Национального Онкологического института, а также Фонд Вирджинии и Д.К. Людвига для Исследований рака, Фонд Стенда Лимонада Алекса, американскую Ассоциацию Опухоли головного мозга, Фонд Исследования Опухоли головного мозга в Джонсе Хопкинсе, Фонд Hoglund, Готовое или Не Фонд, Детский Фонд Опухоли головного мозга, Педиатрический Институт Фонда Опухоли головного мозга, AACR Противостоит Команде Мечты Рака Переводный Грант Исследований рака, Программа Ученого Джонса Хопкинса Соммера, Национальные Институты Здоровья, Национальный научный фонд и Министерство обороны.

Пасторы являются Ученым Исследований рака Грэма в Техасе Детский Онкологический центр.В соответствии с лицензионными соглашениями между Университетом Джонса Хопкинса и Beckman Coulter, Фогелштайном, Кеннетом Кинзлером и Велкулеску названы на долю лицензионных платежей, полученных университетом продаж продуктов, связанных с исследованием, описанным в этой газете. Николас Пападопулос, Фогелштайн, Кинзлер и Велкулеску являются соучредителями Inostics и Personal Genome Diagnostics и являются членами их Научных Консультативных советов.

Пападопулос, Фогелштайн, Кинзлер и Велкулеску владеют акциями Inostics и Personal Genome Diagnostics, подвергающимися определенным ограничениям под университетской политикой. Условия этих мер излечены Университетом Джонса Хопкинса в соответствии с его политикой, направленной на борьбу с должностными злоупотреблениями.Источник: медицина Джонса Хопкинса